Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pm20d2A3KG59 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pm20d2A3KG59 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pm20d2A3KG59 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms