Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc27A2A6Q5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc27A2A6Q5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms