Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
U3KQK5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
U3KQK5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
U3KQK5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
U3KQK5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U3KQK5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U3KQK5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U3KQK5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U3KQK5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
U3KQK5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U3KQK5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U3KQK5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U3KQK5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U3KQK5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U3KQK5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
U3KQK5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
U3KQK5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
U3KQK5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQK5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQK5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQK5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQK5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQK5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQK5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQK5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQK5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQK5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQK5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQK5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQK5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQK5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQK5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQK5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQK5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQK5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQK5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQK5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQK5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQK5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQK5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQK5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQK5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQK5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQK5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQK5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQK5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQK5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQK5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQK5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQK5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQK5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
U3KQK5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQK5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQK5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQK5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQK5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQK5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQK5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQK5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQK5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQK5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQK5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQK5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQK5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQK5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
U3KQK5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
U3KQK5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQK5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQK5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQK5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQK5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQK5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQK5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQK5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQK5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQK5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQK5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQK5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQK5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQK5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U3KQK5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
U3KQK5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
U3KQK5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQK5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQK5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQK5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms