Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Krt85Q9Z2T6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Krt85Q9Z2T6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Krt85Q9Z2T6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Krt85Q9Z2T6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Krt85Q9Z2T6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Krt85Q9Z2T6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Krt85Q9Z2T6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Krt85Q9Z2T6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Krt85Q9Z2T6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Krt85Q9Z2T6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Krt85Q9Z2T6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Krt85Q9Z2T6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Krt85Q9Z2T6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Krt85Q9Z2T6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Krt85Q9Z2T6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Krt85Q9Z2T6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Krt85Q9Z2T6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Krt85Q9Z2T6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Krt85Q9Z2T6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Krt85Q9Z2T6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Krt85Q9Z2T6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Krt85Q9Z2T6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Krt85Q9Z2T6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Krt85Q9Z2T6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Krt85Q9Z2T6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Krt85Q9Z2T6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Krt85Q9Z2T6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Krt85Q9Z2T6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Krt85Q9Z2T6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Krt85Q9Z2T6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Krt85Q9Z2T6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Krt85Q9Z2T6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Krt85Q9Z2T6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Krt85Q9Z2T6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Krt85Q9Z2T6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Krt85Q9Z2T6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Krt85Q9Z2T6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Krt85Q9Z2T6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Krt85Q9Z2T6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Krt85Q9Z2T6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Krt85Q9Z2T6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Krt85Q9Z2T6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Krt85Q9Z2T6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Krt85Q9Z2T6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Krt85Q9Z2T6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Krt85Q9Z2T6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Krt85Q9Z2T6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Krt85Q9Z2T6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Krt85Q9Z2T6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Krt85Q9Z2T6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Krt85Q9Z2T6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Krt85Q9Z2T6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Krt85Q9Z2T6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Krt85Q9Z2T6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Krt85Q9Z2T6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Krt85Q9Z2T6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Krt85Q9Z2T6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Krt85Q9Z2T6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Krt85Q9Z2T6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Krt85Q9Z2T6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Krt85Q9Z2T6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Krt85Q9Z2T6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Krt85Q9Z2T6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Krt85Q9Z2T6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Krt85Q9Z2T6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Krt85Q9Z2T6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Krt85Q9Z2T6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Krt85Q9Z2T6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Krt85Q9Z2T6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Krt85Q9Z2T6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Krt85Q9Z2T6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Krt85Q9Z2T6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms