Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubl3Q9Z2M6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubl3Q9Z2M6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubl3Q9Z2M6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubl3Q9Z2M6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubl3Q9Z2M6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubl3Q9Z2M6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubl3Q9Z2M6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubl3Q9Z2M6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubl3Q9Z2M6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubl3Q9Z2M6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubl3Q9Z2M6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubl3Q9Z2M6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubl3Q9Z2M6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubl3Q9Z2M6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubl3Q9Z2M6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubl3Q9Z2M6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubl3Q9Z2M6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubl3Q9Z2M6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubl3Q9Z2M6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubl3Q9Z2M6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubl3Q9Z2M6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl3Q9Z2M6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl3Q9Z2M6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl3Q9Z2M6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl3Q9Z2M6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubl3Q9Z2M6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubl3Q9Z2M6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubl3Q9Z2M6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubl3Q9Z2M6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubl3Q9Z2M6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubl3Q9Z2M6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubl3Q9Z2M6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubl3Q9Z2M6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubl3Q9Z2M6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubl3Q9Z2M6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubl3Q9Z2M6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubl3Q9Z2M6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms