Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H5

Epb41l1, Band 4.1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l1Q9Z2H5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Epb41l1Q9Z2H5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epb41l1Q9Z2H5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epb41l1Q9Z2H5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epb41l1Q9Z2H5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epb41l1Q9Z2H5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Epb41l1Q9Z2H5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Epb41l1Q9Z2H5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Epb41l1Q9Z2H5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Epb41l1Q9Z2H5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Epb41l1Q9Z2H5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Epb41l1Q9Z2H5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Epb41l1Q9Z2H5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Epb41l1Q9Z2H5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Epb41l1Q9Z2H5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Epb41l1Q9Z2H5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Epb41l1Q9Z2H5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Epb41l1Q9Z2H5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Epb41l1Q9Z2H5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Epb41l1Q9Z2H5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Epb41l1Q9Z2H5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Epb41l1Q9Z2H5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Epb41l1Q9Z2H5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Epb41l1Q9Z2H5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Epb41l1Q9Z2H5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epb41l1Q9Z2H5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epb41l1Q9Z2H5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epb41l1Q9Z2H5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epb41l1Q9Z2H5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epb41l1Q9Z2H5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epb41l1Q9Z2H5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Epb41l1Q9Z2H5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Epb41l1Q9Z2H5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Epb41l1Q9Z2H5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Epb41l1Q9Z2H5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epb41l1Q9Z2H5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epb41l1Q9Z2H5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epb41l1Q9Z2H5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Epb41l1Q9Z2H5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Epb41l1Q9Z2H5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Epb41l1Q9Z2H5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Epb41l1Q9Z2H5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Epb41l1Q9Z2H5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Epb41l1Q9Z2H5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Epb41l1Q9Z2H5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Epb41l1Q9Z2H5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb41l1Q9Z2H5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb41l1Q9Z2H5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Epb41l1Q9Z2H5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Epb41l1Q9Z2H5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Epb41l1Q9Z2H5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Epb41l1Q9Z2H5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Epb41l1Q9Z2H5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Epb41l1Q9Z2H5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epb41l1Q9Z2H5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb41l1Q9Z2H5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epb41l1Q9Z2H5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41l1Q9Z2H5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41l1Q9Z2H5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Epb41l1Q9Z2H5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms