Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mtmr1Q9Z2C4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mtmr1Q9Z2C4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtmr1Q9Z2C4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtmr1Q9Z2C4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtmr1Q9Z2C4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mtmr1Q9Z2C4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mtmr1Q9Z2C4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mtmr1Q9Z2C4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mtmr1Q9Z2C4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mtmr1Q9Z2C4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Mtmr1Q9Z2C4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mtmr1Q9Z2C4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mtmr1Q9Z2C4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mtmr1Q9Z2C4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mtmr1Q9Z2C4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mtmr1Q9Z2C4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mtmr1Q9Z2C4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mtmr1Q9Z2C4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mtmr1Q9Z2C4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mtmr1Q9Z2C4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mtmr1Q9Z2C4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mtmr1Q9Z2C4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mtmr1Q9Z2C4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mtmr1Q9Z2C4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mtmr1Q9Z2C4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mtmr1Q9Z2C4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mtmr1Q9Z2C4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mtmr1Q9Z2C4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mtmr1Q9Z2C4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mtmr1Q9Z2C4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mtmr1Q9Z2C4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mtmr1Q9Z2C4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mtmr1Q9Z2C4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mtmr1Q9Z2C4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mtmr1Q9Z2C4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mtmr1Q9Z2C4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mtmr1Q9Z2C4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mtmr1Q9Z2C4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mtmr1Q9Z2C4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mtmr1Q9Z2C4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Mtmr1Q9Z2C4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mtmr1Q9Z2C4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mtmr1Q9Z2C4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Mtmr1Q9Z2C4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mtmr1Q9Z2C4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mtmr1Q9Z2C4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mtmr1Q9Z2C4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mtmr1Q9Z2C4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mtmr1Q9Z2C4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mtmr1Q9Z2C4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mtmr1Q9Z2C4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mtmr1Q9Z2C4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mtmr1Q9Z2C4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mtmr1Q9Z2C4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mtmr1Q9Z2C4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mtmr1Q9Z2C4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mtmr1Q9Z2C4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mtmr1Q9Z2C4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mtmr1Q9Z2C4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mtmr1Q9Z2C4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Mtmr1Q9Z2C4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms