Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sumo3Q9Z172 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sumo3Q9Z172 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sumo3Q9Z172 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sumo3Q9Z172 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sumo3Q9Z172 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sumo3Q9Z172 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sumo3Q9Z172 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sumo3Q9Z172 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sumo3Q9Z172 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sumo3Q9Z172 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sumo3Q9Z172 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sumo3Q9Z172 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sumo3Q9Z172 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sumo3Q9Z172 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sumo3Q9Z172 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sumo3Q9Z172 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sumo3Q9Z172 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sumo3Q9Z172 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sumo3Q9Z172 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sumo3Q9Z172 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sumo3Q9Z172 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sumo3Q9Z172 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sumo3Q9Z172 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms