Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6I8

PXMP4, Peroxisomal membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP4Q9Y6I8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PXMP4Q9Y6I8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PXMP4Q9Y6I8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PXMP4Q9Y6I8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PXMP4Q9Y6I8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PXMP4Q9Y6I8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PXMP4Q9Y6I8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PXMP4Q9Y6I8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PXMP4Q9Y6I8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PXMP4Q9Y6I8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXMP4Q9Y6I8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXMP4Q9Y6I8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PXMP4Q9Y6I8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PXMP4Q9Y6I8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PXMP4Q9Y6I8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PXMP4Q9Y6I8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PXMP4Q9Y6I8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PXMP4Q9Y6I8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PXMP4Q9Y6I8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PXMP4Q9Y6I8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PXMP4Q9Y6I8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PXMP4Q9Y6I8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PXMP4Q9Y6I8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PXMP4Q9Y6I8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PXMP4Q9Y6I8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PXMP4Q9Y6I8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXMP4Q9Y6I8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PXMP4Q9Y6I8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PXMP4Q9Y6I8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PXMP4Q9Y6I8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PXMP4Q9Y6I8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PXMP4Q9Y6I8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms