Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDY1Q9Y6F8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDY1Q9Y6F8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CDY1Q9Y6F8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDY1Q9Y6F8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDY1Q9Y6F8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDY1Q9Y6F8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDY1Q9Y6F8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDY1Q9Y6F8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDY1Q9Y6F8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDY1Q9Y6F8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDY1Q9Y6F8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDY1Q9Y6F8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDY1Q9Y6F8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDY1Q9Y6F8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDY1Q9Y6F8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDY1Q9Y6F8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDY1Q9Y6F8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDY1Q9Y6F8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDY1Q9Y6F8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDY1Q9Y6F8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDY1Q9Y6F8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDY1Q9Y6F8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDY1Q9Y6F8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDY1Q9Y6F8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDY1Q9Y6F8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDY1Q9Y6F8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CDY1Q9Y6F8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDY1Q9Y6F8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDY1Q9Y6F8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDY1Q9Y6F8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDY1Q9Y6F8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDY1Q9Y6F8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDY1Q9Y6F8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDY1Q9Y6F8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDY1Q9Y6F8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDY1Q9Y6F8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDY1Q9Y6F8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDY1Q9Y6F8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDY1Q9Y6F8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDY1Q9Y6F8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDY1Q9Y6F8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms