Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX5Q9Y5X3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX5Q9Y5X3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX5Q9Y5X3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX5Q9Y5X3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX5Q9Y5X3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX5Q9Y5X3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX5Q9Y5X3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX5Q9Y5X3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX5Q9Y5X3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX5Q9Y5X3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX5Q9Y5X3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX5Q9Y5X3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX5Q9Y5X3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX5Q9Y5X3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX5Q9Y5X3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX5Q9Y5X3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX5Q9Y5X3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX5Q9Y5X3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX5Q9Y5X3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX5Q9Y5X3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX5Q9Y5X3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX5Q9Y5X3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX5Q9Y5X3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX5Q9Y5X3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX5Q9Y5X3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX5Q9Y5X3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX5Q9Y5X3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX5Q9Y5X3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX5Q9Y5X3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX5Q9Y5X3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX5Q9Y5X3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX5Q9Y5X3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX5Q9Y5X3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX5Q9Y5X3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX5Q9Y5X3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX5Q9Y5X3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX5Q9Y5X3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX5Q9Y5X3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX5Q9Y5X3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX5Q9Y5X3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX5Q9Y5X3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms