Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B6Q9Y3B4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3B6Q9Y3B4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3B6Q9Y3B4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3B6Q9Y3B4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B6Q9Y3B4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B6Q9Y3B4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B6Q9Y3B4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B6Q9Y3B4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B6Q9Y3B4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B6Q9Y3B4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3B6Q9Y3B4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SF3B6Q9Y3B4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3B6Q9Y3B4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3B6Q9Y3B4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3B6Q9Y3B4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3B6Q9Y3B4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B6Q9Y3B4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B6Q9Y3B4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B6Q9Y3B4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B6Q9Y3B4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B6Q9Y3B4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3B6Q9Y3B4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3B6Q9Y3B4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B6Q9Y3B4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3B6Q9Y3B4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3B6Q9Y3B4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3B6Q9Y3B4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3B6Q9Y3B4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3B6Q9Y3B4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3B6Q9Y3B4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3B6Q9Y3B4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3B6Q9Y3B4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3B6Q9Y3B4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3B6Q9Y3B4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3B6Q9Y3B4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3B6Q9Y3B4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3B6Q9Y3B4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3B6Q9Y3B4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SF3B6Q9Y3B4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SF3B6Q9Y3B4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SF3B6Q9Y3B4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms