Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT52Q9Y366 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT52Q9Y366 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT52Q9Y366 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT52Q9Y366 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT52Q9Y366 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT52Q9Y366 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT52Q9Y366 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT52Q9Y366 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT52Q9Y366 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT52Q9Y366 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT52Q9Y366 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT52Q9Y366 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT52Q9Y366 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT52Q9Y366 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT52Q9Y366 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT52Q9Y366 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT52Q9Y366 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT52Q9Y366 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT52Q9Y366 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT52Q9Y366 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT52Q9Y366 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT52Q9Y366 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT52Q9Y366 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT52Q9Y366 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT52Q9Y366 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT52Q9Y366 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT52Q9Y366 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT52Q9Y366 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT52Q9Y366 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT52Q9Y366 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT52Q9Y366 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT52Q9Y366 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT52Q9Y366 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT52Q9Y366 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT52Q9Y366 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT52Q9Y366 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT52Q9Y366 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT52Q9Y366 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT52Q9Y366 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT52Q9Y366 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT52Q9Y366 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT52Q9Y366 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT52Q9Y366 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT52Q9Y366 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT52Q9Y366 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT52Q9Y366 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT52Q9Y366 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT52Q9Y366 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT52Q9Y366 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT52Q9Y366 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT52Q9Y366 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT52Q9Y366 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT52Q9Y366 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT52Q9Y366 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms