Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R4

DDX52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX52Q9Y2R4 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)12.63□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 NEDD9-201ENST00000379433 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.14e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 NEDD9-204ENST00000448183 4934 ntTSL 1 (best)7.94□□□□□ -1.144e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 41
DDX52Q9Y2R4 PKNOX1-202ENST00000418336 459 ntTSL 224.63■■□□□ 1.533e-8■■■■■ 40.8
DDX52Q9Y2R4 PKNOX1-206ENST00000480179 1725 ntTSL 216.97■□□□□ 0.313e-8■■■■■ 40.8
DDX52Q9Y2R4 PKNOX1-201ENST00000291547 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 40.8
DDX52Q9Y2R4 PKNOX1-203ENST00000432907 5180 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 40.8
DDX52Q9Y2R4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.396e-10■■■■■ 40.7
DDX52Q9Y2R4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.835e-8■■■■■ 40.5
DDX52Q9Y2R4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.665e-8■■■■■ 40.5
DDX52Q9Y2R4 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 524.72■■□□□ 1.555e-8■■■■■ 40.5
DDX52Q9Y2R4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 40.5
DDX52Q9Y2R4 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 215.78■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 40.5
DDX52Q9Y2R4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.035e-8■■■■■ 40.5
DDX52Q9Y2R4 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.085e-8■■■■■ 40.5
DDX52Q9Y2R4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.455e-10■■■■■ 40.3
DDX52Q9Y2R4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 13e-6■■■■■ 40.2
DDX52Q9Y2R4 ERICH1-202ENST00000518277 788 ntTSL 219.41■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 40.2
DDX52Q9Y2R4 ERICH1-211ENST00000524138 682 ntTSL 318.78■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 40.2
DDX52Q9Y2R4 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 40.2
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-204ENST00000417107 569 ntTSL 421.4■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-213ENST00000440293 580 ntTSL 421.4■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-205ENST00000417902 576 ntTSL 321.4■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-212ENST00000434070 645 ntTSL 421.18■□□□□ 0.989e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.949e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-208ENST00000425451 621 ntTSL 520.88■□□□□ 0.939e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-210ENST00000430670 914 ntTSL 520.07■□□□□ 0.89e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-211ENST00000433685 402 ntTSL 318.87■□□□□ 0.619e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.479e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-215ENST00000447463 555 ntTSL 415.65■□□□□ 0.19e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 WDR1-211ENST00000508079 812 ntTSL 314.65□□□□□ -0.069e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 39.8
DDX52Q9Y2R4 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 321.12■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 39.5
DDX52Q9Y2R4 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 318.77■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 39.5
DDX52Q9Y2R4 CLCN7-204ENST00000561665 561 ntTSL 426.95■■□□□ 1.91e-6■■■■■ 39.5
DDX52Q9Y2R4 CLCN7-211ENST00000567139 581 ntTSL 224.7■■□□□ 1.541e-6■■■■■ 39.5
DDX52Q9Y2R4 CLCN7-214ENST00000569851 1014 ntTSL 519.33■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 39.5
DDX52Q9Y2R4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 39.5
DDX52Q9Y2R4 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 39.5
DDX52Q9Y2R4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 39.5
DDX52Q9Y2R4 ASMTL-AS1-201ENST00000419737 553 ntTSL 216■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 39.3
DDX52Q9Y2R4 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 39.3
DDX52Q9Y2R4 ASMTL-AS1-202ENST00000420411 697 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 39.3
DDX52Q9Y2R4 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.126e-10■■■■■ 38.9
DDX52Q9Y2R4 ZFHX4-AS1-204ENST00000522961 240 ntTSL 514.11□□□□□ -0.156e-10■■■■■ 38.9
DDX52Q9Y2R4 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 319.85■□□□□ 0.778e-8■■■■■ 38.3
DDX52Q9Y2R4 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 219.76■□□□□ 0.758e-8■■■■■ 38.3
DDX52Q9Y2R4 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)15.51■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 38.3
DDX52Q9Y2R4 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 513.06□□□□□ -0.328e-8■■■■■ 38.3
DDX52Q9Y2R4 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.378e-8■■■■■ 38.3
DDX52Q9Y2R4 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.438e-8■■■■■ 38.3
DDX52Q9Y2R4 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.538e-8■■■■■ 38.3
DDX52Q9Y2R4 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.618e-8■■■■■ 38.3
DDX52Q9Y2R4 TMEM18-206ENST00000461640 844 ntTSL 326.71■■□□□ 1.871e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 WDR1-209ENST00000505851 715 ntTSL 226.14■■□□□ 1.781e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 TMEM18-207ENST00000477202 1767 ntTSL 225.44■■□□□ 1.661e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-214ENST00000445237 364 ntTSL 421.18■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 LRRC4B-203ENST00000600381 853 ntTSL 221.01■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 TMEM18-204ENST00000418447 623 ntTSL 320.37■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 NADK-208ENST00000477235 1004 ntTSL 219.6■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-206ENST00000421231 583 ntTSL 418.6■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-207ENST00000422254 593 ntTSL 418.6■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 HDAC7-216ENST00000450805 579 ntTSL 417.91■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 NADK-214ENST00000497186 683 ntTSL 317.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 NADK-207ENST00000469045 890 ntTSL 517.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 PPP1R12C-204ENST00000586992 4141 nt16.59■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 WDR1-216ENST00000514319 719 ntTSL 516.26■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 NADK-211ENST00000489538 475 ntTSL 316.19■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 NADK-209ENST00000480499 549 ntTSL 215.91■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 37.9
DDX52Q9Y2R4 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 518.87■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 38.59□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TPST2-205ENST00000442495 586 ntTSL 225.7■■□□□ 1.71e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.681e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TPST2-207ENST00000450022 544 ntTSL 324.03■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TPST2-204ENST00000440953 544 ntTSL 521.77■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TMEM18-205ENST00000432667 2572 ntTSL 516.5■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-211ENST00000484104 725 ntTSL 224.2■■□□□ 1.463e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-214ENST00000493924 1573 ntTSL 523.57■■□□□ 1.363e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-210ENST00000483227 886 ntTSL 1 (best)23.26■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-205ENST00000437313 734 ntTSL 522.87■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 37.6
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