Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP8A1Q9Y2Q0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP8A1Q9Y2Q0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP8A1Q9Y2Q0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP8A1Q9Y2Q0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP8A1Q9Y2Q0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP8A1Q9Y2Q0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP8A1Q9Y2Q0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP8A1Q9Y2Q0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP8A1Q9Y2Q0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP8A1Q9Y2Q0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP8A1Q9Y2Q0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP8A1Q9Y2Q0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP8A1Q9Y2Q0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP8A1Q9Y2Q0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8A1Q9Y2Q0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8A1Q9Y2Q0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8A1Q9Y2Q0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP8A1Q9Y2Q0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP8A1Q9Y2Q0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP8A1Q9Y2Q0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP8A1Q9Y2Q0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP8A1Q9Y2Q0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP8A1Q9Y2Q0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP8A1Q9Y2Q0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8A1Q9Y2Q0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8A1Q9Y2Q0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8A1Q9Y2Q0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8A1Q9Y2Q0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP8A1Q9Y2Q0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP8A1Q9Y2Q0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP8A1Q9Y2Q0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms