Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP20Q9Y2K6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP20Q9Y2K6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP20Q9Y2K6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP20Q9Y2K6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP20Q9Y2K6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP20Q9Y2K6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP20Q9Y2K6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP20Q9Y2K6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP20Q9Y2K6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP20Q9Y2K6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP20Q9Y2K6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP20Q9Y2K6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP20Q9Y2K6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
USP20Q9Y2K6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP20Q9Y2K6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP20Q9Y2K6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP20Q9Y2K6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP20Q9Y2K6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP20Q9Y2K6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP20Q9Y2K6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP20Q9Y2K6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP20Q9Y2K6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP20Q9Y2K6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP20Q9Y2K6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP20Q9Y2K6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP20Q9Y2K6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP20Q9Y2K6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP20Q9Y2K6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP20Q9Y2K6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP20Q9Y2K6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
USP20Q9Y2K6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP20Q9Y2K6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
USP20Q9Y2K6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP20Q9Y2K6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP20Q9Y2K6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP20Q9Y2K6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP20Q9Y2K6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP20Q9Y2K6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP20Q9Y2K6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP20Q9Y2K6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP20Q9Y2K6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP20Q9Y2K6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP20Q9Y2K6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP20Q9Y2K6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP20Q9Y2K6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP20Q9Y2K6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP20Q9Y2K6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP20Q9Y2K6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP20Q9Y2K6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP20Q9Y2K6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USP20Q9Y2K6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP20Q9Y2K6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP20Q9Y2K6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP20Q9Y2K6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP20Q9Y2K6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms