Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHKBQ9Y259 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHKBQ9Y259 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHKBQ9Y259 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHKBQ9Y259 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHKBQ9Y259 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHKBQ9Y259 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHKBQ9Y259 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHKBQ9Y259 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHKBQ9Y259 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHKBQ9Y259 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHKBQ9Y259 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHKBQ9Y259 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHKBQ9Y259 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHKBQ9Y259 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHKBQ9Y259 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHKBQ9Y259 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHKBQ9Y259 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHKBQ9Y259 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHKBQ9Y259 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHKBQ9Y259 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHKBQ9Y259 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHKBQ9Y259 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHKBQ9Y259 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHKBQ9Y259 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHKBQ9Y259 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHKBQ9Y259 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHKBQ9Y259 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHKBQ9Y259 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHKBQ9Y259 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHKBQ9Y259 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHKBQ9Y259 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHKBQ9Y259 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHKBQ9Y259 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHKBQ9Y259 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHKBQ9Y259 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHKBQ9Y259 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHKBQ9Y259 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHKBQ9Y259 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHKBQ9Y259 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHKBQ9Y259 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHKBQ9Y259 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHKBQ9Y259 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHKBQ9Y259 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CHKBQ9Y259 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CHKBQ9Y259 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHKBQ9Y259 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHKBQ9Y259 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms