Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM50BQ9Y247 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM50BQ9Y247 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM50BQ9Y247 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM50BQ9Y247 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM50BQ9Y247 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM50BQ9Y247 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM50BQ9Y247 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM50BQ9Y247 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM50BQ9Y247 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM50BQ9Y247 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM50BQ9Y247 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM50BQ9Y247 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM50BQ9Y247 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM50BQ9Y247 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM50BQ9Y247 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM50BQ9Y247 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM50BQ9Y247 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM50BQ9Y247 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM50BQ9Y247 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM50BQ9Y247 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM50BQ9Y247 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM50BQ9Y247 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM50BQ9Y247 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM50BQ9Y247 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM50BQ9Y247 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM50BQ9Y247 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM50BQ9Y247 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM50BQ9Y247 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM50BQ9Y247 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM50BQ9Y247 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM50BQ9Y247 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM50BQ9Y247 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM50BQ9Y247 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM50BQ9Y247 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM50BQ9Y247 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM50BQ9Y247 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM50BQ9Y247 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM50BQ9Y247 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM50BQ9Y247 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM50BQ9Y247 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM50BQ9Y247 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM50BQ9Y247 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM50BQ9Y247 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM50BQ9Y247 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM50BQ9Y247 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM50BQ9Y247 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM50BQ9Y247 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM50BQ9Y247 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM50BQ9Y247 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM50BQ9Y247 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM50BQ9Y247 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM50BQ9Y247 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM50BQ9Y247 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM50BQ9Y247 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM50BQ9Y247 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM50BQ9Y247 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM50BQ9Y247 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM50BQ9Y247 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM50BQ9Y247 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM50BQ9Y247 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM50BQ9Y247 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM50BQ9Y247 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM50BQ9Y247 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM50BQ9Y247 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM50BQ9Y247 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM50BQ9Y247 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM50BQ9Y247 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM50BQ9Y247 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms