Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y225

RNF24, RING finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF24Q9Y225 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNF24Q9Y225 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RNF24Q9Y225 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNF24Q9Y225 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF24Q9Y225 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF24Q9Y225 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF24Q9Y225 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNF24Q9Y225 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNF24Q9Y225 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RNF24Q9Y225 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNF24Q9Y225 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RNF24Q9Y225 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RNF24Q9Y225 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RNF24Q9Y225 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RNF24Q9Y225 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RNF24Q9Y225 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RNF24Q9Y225 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RNF24Q9Y225 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNF24Q9Y225 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNF24Q9Y225 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RNF24Q9Y225 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNF24Q9Y225 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RNF24Q9Y225 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RNF24Q9Y225 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNF24Q9Y225 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNF24Q9Y225 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNF24Q9Y225 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF24Q9Y225 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF24Q9Y225 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF24Q9Y225 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF24Q9Y225 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF24Q9Y225 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF24Q9Y225 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms