Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Apobec2Q9WV35 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apobec2Q9WV35 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apobec2Q9WV35 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Apobec2Q9WV35 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apobec2Q9WV35 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apobec2Q9WV35 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apobec2Q9WV35 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apobec2Q9WV35 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Apobec2Q9WV35 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Apobec2Q9WV35 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Apobec2Q9WV35 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apobec2Q9WV35 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apobec2Q9WV35 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apobec2Q9WV35 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apobec2Q9WV35 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apobec2Q9WV35 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apobec2Q9WV35 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apobec2Q9WV35 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Apobec2Q9WV35 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apobec2Q9WV35 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apobec2Q9WV35 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apobec2Q9WV35 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apobec2Q9WV35 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apobec2Q9WV35 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apobec2Q9WV35 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Apobec2Q9WV35 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apobec2Q9WV35 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apobec2Q9WV35 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Apobec2Q9WV35 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apobec2Q9WV35 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apobec2Q9WV35 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apobec2Q9WV35 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apobec2Q9WV35 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apobec2Q9WV35 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apobec2Q9WV35 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apobec2Q9WV35 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apobec2Q9WV35 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apobec2Q9WV35 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apobec2Q9WV35 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apobec2Q9WV35 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apobec2Q9WV35 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apobec2Q9WV35 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Apobec2Q9WV35 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apobec2Q9WV35 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apobec2Q9WV35 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apobec2Q9WV35 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apobec2Q9WV35 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apobec2Q9WV35 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Apobec2Q9WV35 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apobec2Q9WV35 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apobec2Q9WV35 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apobec2Q9WV35 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apobec2Q9WV35 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apobec2Q9WV35 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Apobec2Q9WV35 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apobec2Q9WV35 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apobec2Q9WV35 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apobec2Q9WV35 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apobec2Q9WV35 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Apobec2Q9WV35 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apobec2Q9WV35 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apobec2Q9WV35 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apobec2Q9WV35 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apobec2Q9WV35 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Apobec2Q9WV35 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apobec2Q9WV35 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Apobec2Q9WV35 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Apobec2Q9WV35 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apobec2Q9WV35 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apobec2Q9WV35 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apobec2Q9WV35 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apobec2Q9WV35 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apobec2Q9WV35 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apobec2Q9WV35 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apobec2Q9WV35 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apobec2Q9WV35 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apobec2Q9WV35 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apobec2Q9WV35 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apobec2Q9WV35 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apobec2Q9WV35 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec2Q9WV35 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Apobec2Q9WV35 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apobec2Q9WV35 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apobec2Q9WV35 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apobec2Q9WV35 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Apobec2Q9WV35 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apobec2Q9WV35 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apobec2Q9WV35 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apobec2Q9WV35 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apobec2Q9WV35 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apobec2Q9WV35 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apobec2Q9WV35 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apobec2Q9WV35 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apobec2Q9WV35 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apobec2Q9WV35 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apobec2Q9WV35 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Apobec2Q9WV35 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apobec2Q9WV35 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apobec2Q9WV35 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms