Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gabbr1Q9WV18 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gabbr1Q9WV18 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gabbr1Q9WV18 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gabbr1Q9WV18 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gabbr1Q9WV18 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gabbr1Q9WV18 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gabbr1Q9WV18 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gabbr1Q9WV18 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gabbr1Q9WV18 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gabbr1Q9WV18 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gabbr1Q9WV18 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gabbr1Q9WV18 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gabbr1Q9WV18 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gabbr1Q9WV18 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gabbr1Q9WV18 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gabbr1Q9WV18 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gabbr1Q9WV18 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gabbr1Q9WV18 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gabbr1Q9WV18 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gabbr1Q9WV18 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gabbr1Q9WV18 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gabbr1Q9WV18 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gabbr1Q9WV18 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gabbr1Q9WV18 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gabbr1Q9WV18 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gabbr1Q9WV18 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gabbr1Q9WV18 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gabbr1Q9WV18 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gabbr1Q9WV18 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gabbr1Q9WV18 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gabbr1Q9WV18 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gabbr1Q9WV18 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gabbr1Q9WV18 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Gabbr1Q9WV18 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gabbr1Q9WV18 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gabbr1Q9WV18 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gabbr1Q9WV18 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gabbr1Q9WV18 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gabbr1Q9WV18 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gabbr1Q9WV18 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gabbr1Q9WV18 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gabbr1Q9WV18 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gabbr1Q9WV18 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gabbr1Q9WV18 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gabbr1Q9WV18 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Gabbr1Q9WV18 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gabbr1Q9WV18 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gabbr1Q9WV18 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gabbr1Q9WV18 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gabbr1Q9WV18 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gabbr1Q9WV18 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gabbr1Q9WV18 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gabbr1Q9WV18 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gabbr1Q9WV18 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gabbr1Q9WV18 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gabbr1Q9WV18 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gabbr1Q9WV18 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gabbr1Q9WV18 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabbr1Q9WV18 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gabbr1Q9WV18 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gabbr1Q9WV18 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gabbr1Q9WV18 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Gabbr1Q9WV18 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gabbr1Q9WV18 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gabbr1Q9WV18 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gabbr1Q9WV18 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gabbr1Q9WV18 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gabbr1Q9WV18 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gabbr1Q9WV18 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gabbr1Q9WV18 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gabbr1Q9WV18 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gabbr1Q9WV18 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gabbr1Q9WV18 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gabbr1Q9WV18 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gabbr1Q9WV18 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gabbr1Q9WV18 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gabbr1Q9WV18 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gabbr1Q9WV18 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gabbr1Q9WV18 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gabbr1Q9WV18 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gabbr1Q9WV18 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gabbr1Q9WV18 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gabbr1Q9WV18 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gabbr1Q9WV18 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gabbr1Q9WV18 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gabbr1Q9WV18 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms