Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tnip1Q9WUU8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tnip1Q9WUU8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tnip1Q9WUU8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tnip1Q9WUU8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tnip1Q9WUU8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Tnip1Q9WUU8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tnip1Q9WUU8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tnip1Q9WUU8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tnip1Q9WUU8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tnip1Q9WUU8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tnip1Q9WUU8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tnip1Q9WUU8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tnip1Q9WUU8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tnip1Q9WUU8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tnip1Q9WUU8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tnip1Q9WUU8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tnip1Q9WUU8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Tnip1Q9WUU8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tnip1Q9WUU8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tnip1Q9WUU8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tnip1Q9WUU8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tnip1Q9WUU8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tnip1Q9WUU8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tnip1Q9WUU8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tnip1Q9WUU8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tnip1Q9WUU8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tnip1Q9WUU8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tnip1Q9WUU8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tnip1Q9WUU8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tnip1Q9WUU8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tnip1Q9WUU8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Tnip1Q9WUU8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnip1Q9WUU8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tnip1Q9WUU8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tnip1Q9WUU8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tnip1Q9WUU8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Tnip1Q9WUU8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tnip1Q9WUU8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tnip1Q9WUU8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Tnip1Q9WUU8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tnip1Q9WUU8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tnip1Q9WUU8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tnip1Q9WUU8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnip1Q9WUU8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tnip1Q9WUU8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tnip1Q9WUU8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Tnip1Q9WUU8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tnip1Q9WUU8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tnip1Q9WUU8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tnip1Q9WUU8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tnip1Q9WUU8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tnip1Q9WUU8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tnip1Q9WUU8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tnip1Q9WUU8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tnip1Q9WUU8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tnip1Q9WUU8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnip1Q9WUU8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tnip1Q9WUU8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tnip1Q9WUU8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tnip1Q9WUU8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tnip1Q9WUU8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Tnip1Q9WUU8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnip1Q9WUU8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnip1Q9WUU8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnip1Q9WUU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tnip1Q9WUU8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tnip1Q9WUU8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tnip1Q9WUU8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tnip1Q9WUU8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tnip1Q9WUU8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Tnip1Q9WUU8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tnip1Q9WUU8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tnip1Q9WUU8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tnip1Q9WUU8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnip1Q9WUU8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnip1Q9WUU8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tnip1Q9WUU8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tnip1Q9WUU8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tnip1Q9WUU8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tnip1Q9WUU8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnip1Q9WUU8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tnip1Q9WUU8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tnip1Q9WUU8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tnip1Q9WUU8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tnip1Q9WUU8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms