Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUN8

Lbx2, Transcription factor LBX2, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx2Q9WUN8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lbx2Q9WUN8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lbx2Q9WUN8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lbx2Q9WUN8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lbx2Q9WUN8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lbx2Q9WUN8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lbx2Q9WUN8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lbx2Q9WUN8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lbx2Q9WUN8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lbx2Q9WUN8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lbx2Q9WUN8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lbx2Q9WUN8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lbx2Q9WUN8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lbx2Q9WUN8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lbx2Q9WUN8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lbx2Q9WUN8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lbx2Q9WUN8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lbx2Q9WUN8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lbx2Q9WUN8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lbx2Q9WUN8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lbx2Q9WUN8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lbx2Q9WUN8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lbx2Q9WUN8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lbx2Q9WUN8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lbx2Q9WUN8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lbx2Q9WUN8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lbx2Q9WUN8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lbx2Q9WUN8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lbx2Q9WUN8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lbx2Q9WUN8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lbx2Q9WUN8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lbx2Q9WUN8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lbx2Q9WUN8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lbx2Q9WUN8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lbx2Q9WUN8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lbx2Q9WUN8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lbx2Q9WUN8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lbx2Q9WUN8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lbx2Q9WUN8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lbx2Q9WUN8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lbx2Q9WUN8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lbx2Q9WUN8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lbx2Q9WUN8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lbx2Q9WUN8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lbx2Q9WUN8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lbx2Q9WUN8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lbx2Q9WUN8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms