Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbck1Q9WUB0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbck1Q9WUB0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbck1Q9WUB0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbck1Q9WUB0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbck1Q9WUB0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbck1Q9WUB0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbck1Q9WUB0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbck1Q9WUB0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbck1Q9WUB0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbck1Q9WUB0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbck1Q9WUB0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbck1Q9WUB0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbck1Q9WUB0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbck1Q9WUB0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbck1Q9WUB0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbck1Q9WUB0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbck1Q9WUB0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbck1Q9WUB0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbck1Q9WUB0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbck1Q9WUB0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbck1Q9WUB0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbck1Q9WUB0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbck1Q9WUB0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbck1Q9WUB0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbck1Q9WUB0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbck1Q9WUB0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbck1Q9WUB0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbck1Q9WUB0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbck1Q9WUB0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbck1Q9WUB0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbck1Q9WUB0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbck1Q9WUB0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbck1Q9WUB0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbck1Q9WUB0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbck1Q9WUB0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbck1Q9WUB0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbck1Q9WUB0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbck1Q9WUB0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbck1Q9WUB0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbck1Q9WUB0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbck1Q9WUB0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbck1Q9WUB0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbck1Q9WUB0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbck1Q9WUB0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbck1Q9WUB0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbck1Q9WUB0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbck1Q9WUB0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbck1Q9WUB0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbck1Q9WUB0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbck1Q9WUB0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbck1Q9WUB0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbck1Q9WUB0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbck1Q9WUB0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbck1Q9WUB0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbck1Q9WUB0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbck1Q9WUB0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbck1Q9WUB0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms