Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMK2AQ9UQM7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMK2AQ9UQM7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMK2AQ9UQM7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMK2AQ9UQM7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMK2AQ9UQM7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMK2AQ9UQM7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMK2AQ9UQM7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMK2AQ9UQM7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMK2AQ9UQM7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMK2AQ9UQM7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMK2AQ9UQM7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAMK2AQ9UQM7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMK2AQ9UQM7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMK2AQ9UQM7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMK2AQ9UQM7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMK2AQ9UQM7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMK2AQ9UQM7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMK2AQ9UQM7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMK2AQ9UQM7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMK2AQ9UQM7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMK2AQ9UQM7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMK2AQ9UQM7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMK2AQ9UQM7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMK2AQ9UQM7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAMK2AQ9UQM7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAMK2AQ9UQM7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMK2AQ9UQM7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMK2AQ9UQM7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMK2AQ9UQM7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMK2AQ9UQM7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMK2AQ9UQM7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMK2AQ9UQM7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMK2AQ9UQM7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMK2AQ9UQM7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMK2AQ9UQM7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMK2AQ9UQM7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMK2AQ9UQM7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMK2AQ9UQM7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAMK2AQ9UQM7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMK2AQ9UQM7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms