Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVW-1Q9UQF0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVW-1Q9UQF0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVW-1Q9UQF0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVW-1Q9UQF0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVW-1Q9UQF0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVW-1Q9UQF0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVW-1Q9UQF0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVW-1Q9UQF0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVW-1Q9UQF0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVW-1Q9UQF0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVW-1Q9UQF0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVW-1Q9UQF0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVW-1Q9UQF0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVW-1Q9UQF0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVW-1Q9UQF0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVW-1Q9UQF0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVW-1Q9UQF0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVW-1Q9UQF0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVW-1Q9UQF0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVW-1Q9UQF0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVW-1Q9UQF0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVW-1Q9UQF0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVW-1Q9UQF0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVW-1Q9UQF0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVW-1Q9UQF0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVW-1Q9UQF0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVW-1Q9UQF0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVW-1Q9UQF0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVW-1Q9UQF0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVW-1Q9UQF0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVW-1Q9UQF0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVW-1Q9UQF0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVW-1Q9UQF0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVW-1Q9UQF0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ERVW-1Q9UQF0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVW-1Q9UQF0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERVW-1Q9UQF0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVW-1Q9UQF0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVW-1Q9UQF0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVW-1Q9UQF0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVW-1Q9UQF0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVW-1Q9UQF0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVW-1Q9UQF0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVW-1Q9UQF0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVW-1Q9UQF0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVW-1Q9UQF0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVW-1Q9UQF0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVW-1Q9UQF0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVW-1Q9UQF0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVW-1Q9UQF0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVW-1Q9UQF0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVW-1Q9UQF0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms