Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB9

AURKC, Aurora kinase C, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKCQ9UQB9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AURKCQ9UQB9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AURKCQ9UQB9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AURKCQ9UQB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AURKCQ9UQB9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AURKCQ9UQB9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AURKCQ9UQB9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AURKCQ9UQB9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AURKCQ9UQB9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AURKCQ9UQB9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AURKCQ9UQB9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AURKCQ9UQB9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AURKCQ9UQB9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AURKCQ9UQB9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AURKCQ9UQB9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AURKCQ9UQB9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AURKCQ9UQB9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AURKCQ9UQB9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AURKCQ9UQB9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AURKCQ9UQB9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AURKCQ9UQB9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AURKCQ9UQB9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AURKCQ9UQB9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AURKCQ9UQB9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AURKCQ9UQB9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AURKCQ9UQB9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AURKCQ9UQB9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AURKCQ9UQB9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AURKCQ9UQB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AURKCQ9UQB9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AURKCQ9UQB9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms