Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS4AQ9UN37 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS4AQ9UN37 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS4AQ9UN37 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS4AQ9UN37 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS4AQ9UN37 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VPS4AQ9UN37 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS4AQ9UN37 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS4AQ9UN37 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS4AQ9UN37 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS4AQ9UN37 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS4AQ9UN37 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS4AQ9UN37 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS4AQ9UN37 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS4AQ9UN37 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS4AQ9UN37 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS4AQ9UN37 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS4AQ9UN37 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS4AQ9UN37 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS4AQ9UN37 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS4AQ9UN37 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS4AQ9UN37 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS4AQ9UN37 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS4AQ9UN37 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS4AQ9UN37 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS4AQ9UN37 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS4AQ9UN37 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS4AQ9UN37 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS4AQ9UN37 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS4AQ9UN37 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS4AQ9UN37 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS4AQ9UN37 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS4AQ9UN37 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS4AQ9UN37 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS4AQ9UN37 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS4AQ9UN37 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS4AQ9UN37 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS4AQ9UN37 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS4AQ9UN37 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS4AQ9UN37 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS4AQ9UN37 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS4AQ9UN37 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS4AQ9UN37 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS4AQ9UN37 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS4AQ9UN37 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS4AQ9UN37 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS4AQ9UN37 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS4AQ9UN37 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS4AQ9UN37 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS4AQ9UN37 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS4AQ9UN37 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS4AQ9UN37 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS4AQ9UN37 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS4AQ9UN37 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 486.3 ms