Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FZD4Q9ULV1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FZD4Q9ULV1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FZD4Q9ULV1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FZD4Q9ULV1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FZD4Q9ULV1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FZD4Q9ULV1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FZD4Q9ULV1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FZD4Q9ULV1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FZD4Q9ULV1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FZD4Q9ULV1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FZD4Q9ULV1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FZD4Q9ULV1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FZD4Q9ULV1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FZD4Q9ULV1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FZD4Q9ULV1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FZD4Q9ULV1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FZD4Q9ULV1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FZD4Q9ULV1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FZD4Q9ULV1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FZD4Q9ULV1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FZD4Q9ULV1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FZD4Q9ULV1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FZD4Q9ULV1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FZD4Q9ULV1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FZD4Q9ULV1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FZD4Q9ULV1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FZD4Q9ULV1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FZD4Q9ULV1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FZD4Q9ULV1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FZD4Q9ULV1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FZD4Q9ULV1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FZD4Q9ULV1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD4Q9ULV1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms