Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PALD1Q9ULE6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PALD1Q9ULE6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PALD1Q9ULE6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PALD1Q9ULE6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PALD1Q9ULE6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PALD1Q9ULE6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PALD1Q9ULE6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PALD1Q9ULE6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PALD1Q9ULE6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PALD1Q9ULE6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PALD1Q9ULE6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PALD1Q9ULE6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PALD1Q9ULE6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PALD1Q9ULE6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PALD1Q9ULE6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PALD1Q9ULE6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PALD1Q9ULE6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PALD1Q9ULE6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PALD1Q9ULE6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PALD1Q9ULE6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PALD1Q9ULE6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PALD1Q9ULE6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PALD1Q9ULE6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PALD1Q9ULE6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PALD1Q9ULE6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PALD1Q9ULE6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PALD1Q9ULE6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PALD1Q9ULE6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PALD1Q9ULE6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PALD1Q9ULE6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PALD1Q9ULE6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PALD1Q9ULE6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PALD1Q9ULE6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PALD1Q9ULE6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PALD1Q9ULE6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PALD1Q9ULE6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PALD1Q9ULE6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PALD1Q9ULE6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PALD1Q9ULE6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PALD1Q9ULE6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PALD1Q9ULE6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PALD1Q9ULE6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PALD1Q9ULE6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PALD1Q9ULE6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PALD1Q9ULE6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PALD1Q9ULE6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PALD1Q9ULE6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PALD1Q9ULE6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PALD1Q9ULE6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PALD1Q9ULE6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PALD1Q9ULE6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PALD1Q9ULE6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PALD1Q9ULE6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PALD1Q9ULE6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PALD1Q9ULE6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PALD1Q9ULE6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PALD1Q9ULE6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PALD1Q9ULE6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PALD1Q9ULE6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PALD1Q9ULE6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PALD1Q9ULE6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PALD1Q9ULE6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PALD1Q9ULE6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PALD1Q9ULE6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PALD1Q9ULE6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PALD1Q9ULE6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PALD1Q9ULE6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PALD1Q9ULE6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PALD1Q9ULE6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PALD1Q9ULE6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PALD1Q9ULE6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PALD1Q9ULE6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PALD1Q9ULE6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PALD1Q9ULE6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms