Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH7Q9ULB5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDH7Q9ULB5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH7Q9ULB5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH7Q9ULB5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDH7Q9ULB5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDH7Q9ULB5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDH7Q9ULB5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDH7Q9ULB5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDH7Q9ULB5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDH7Q9ULB5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDH7Q9ULB5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDH7Q9ULB5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDH7Q9ULB5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDH7Q9ULB5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDH7Q9ULB5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDH7Q9ULB5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDH7Q9ULB5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDH7Q9ULB5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDH7Q9ULB5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDH7Q9ULB5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CDH7Q9ULB5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDH7Q9ULB5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDH7Q9ULB5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDH7Q9ULB5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDH7Q9ULB5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDH7Q9ULB5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDH7Q9ULB5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDH7Q9ULB5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDH7Q9ULB5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDH7Q9ULB5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDH7Q9ULB5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDH7Q9ULB5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDH7Q9ULB5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDH7Q9ULB5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDH7Q9ULB5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDH7Q9ULB5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDH7Q9ULB5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDH7Q9ULB5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDH7Q9ULB5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH7Q9ULB5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH7Q9ULB5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDH7Q9ULB5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDH7Q9ULB5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDH7Q9ULB5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDH7Q9ULB5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH7Q9ULB5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH7Q9ULB5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH7Q9ULB5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH7Q9ULB5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH7Q9ULB5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH7Q9ULB5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDH7Q9ULB5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH7Q9ULB5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH7Q9ULB5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDH7Q9ULB5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDH7Q9ULB5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDH7Q9ULB5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDH7Q9ULB5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDH7Q9ULB5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDH7Q9ULB5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDH7Q9ULB5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH7Q9ULB5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH7Q9ULB5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CDH7Q9ULB5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDH7Q9ULB5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDH7Q9ULB5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDH7Q9ULB5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH7Q9ULB5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH7Q9ULB5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDH7Q9ULB5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDH7Q9ULB5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDH7Q9ULB5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms