Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL46

PSME2, Proteasome activator complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME2Q9UL46 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSME2Q9UL46 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSME2Q9UL46 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME2Q9UL46 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSME2Q9UL46 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSME2Q9UL46 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSME2Q9UL46 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME2Q9UL46 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSME2Q9UL46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSME2Q9UL46 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSME2Q9UL46 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME2Q9UL46 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSME2Q9UL46 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSME2Q9UL46 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSME2Q9UL46 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME2Q9UL46 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME2Q9UL46 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME2Q9UL46 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME2Q9UL46 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME2Q9UL46 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME2Q9UL46 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSME2Q9UL46 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSME2Q9UL46 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME2Q9UL46 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSME2Q9UL46 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME2Q9UL46 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME2Q9UL46 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSME2Q9UL46 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSME2Q9UL46 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSME2Q9UL46 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSME2Q9UL46 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME2Q9UL46 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME2Q9UL46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME2Q9UL46 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME2Q9UL46 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME2Q9UL46 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME2Q9UL46 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME2Q9UL46 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME2Q9UL46 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME2Q9UL46 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME2Q9UL46 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME2Q9UL46 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME2Q9UL46 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME2Q9UL46 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME2Q9UL46 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME2Q9UL46 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME2Q9UL46 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME2Q9UL46 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME2Q9UL46 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSME2Q9UL46 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME2Q9UL46 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME2Q9UL46 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms