Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGA11Q9UKX5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGA11Q9UKX5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGA11Q9UKX5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGA11Q9UKX5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGA11Q9UKX5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGA11Q9UKX5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGA11Q9UKX5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGA11Q9UKX5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGA11Q9UKX5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGA11Q9UKX5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGA11Q9UKX5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGA11Q9UKX5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGA11Q9UKX5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGA11Q9UKX5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGA11Q9UKX5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGA11Q9UKX5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGA11Q9UKX5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA11Q9UKX5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA11Q9UKX5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA11Q9UKX5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGA11Q9UKX5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGA11Q9UKX5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGA11Q9UKX5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA11Q9UKX5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA11Q9UKX5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGA11Q9UKX5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGA11Q9UKX5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGA11Q9UKX5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGA11Q9UKX5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGA11Q9UKX5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGA11Q9UKX5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGA11Q9UKX5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGA11Q9UKX5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGA11Q9UKX5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGA11Q9UKX5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA11Q9UKX5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGA11Q9UKX5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGA11Q9UKX5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA11Q9UKX5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGA11Q9UKX5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA11Q9UKX5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA11Q9UKX5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA11Q9UKX5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGA11Q9UKX5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA11Q9UKX5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA11Q9UKX5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGA11Q9UKX5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ITGA11Q9UKX5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGA11Q9UKX5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGA11Q9UKX5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGA11Q9UKX5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA11Q9UKX5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA11Q9UKX5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA11Q9UKX5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGA11Q9UKX5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA11Q9UKX5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA11Q9UKX5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA11Q9UKX5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGA11Q9UKX5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA11Q9UKX5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA11Q9UKX5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGA11Q9UKX5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA11Q9UKX5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms