Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP3Q9UKI2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP3Q9UKI2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP3Q9UKI2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP3Q9UKI2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP3Q9UKI2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP3Q9UKI2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP3Q9UKI2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP3Q9UKI2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP3Q9UKI2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42EP3Q9UKI2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP3Q9UKI2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP3Q9UKI2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42EP3Q9UKI2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP3Q9UKI2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP3Q9UKI2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP3Q9UKI2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC42EP3Q9UKI2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP3Q9UKI2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42EP3Q9UKI2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP3Q9UKI2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP3Q9UKI2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP3Q9UKI2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP3Q9UKI2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP3Q9UKI2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP3Q9UKI2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP3Q9UKI2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP3Q9UKI2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP3Q9UKI2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP3Q9UKI2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms