Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CROTQ9UKG9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CROTQ9UKG9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CROTQ9UKG9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CROTQ9UKG9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CROTQ9UKG9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CROTQ9UKG9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CROTQ9UKG9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CROTQ9UKG9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CROTQ9UKG9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CROTQ9UKG9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CROTQ9UKG9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CROTQ9UKG9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CROTQ9UKG9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CROTQ9UKG9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CROTQ9UKG9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CROTQ9UKG9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CROTQ9UKG9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CROTQ9UKG9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CROTQ9UKG9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CROTQ9UKG9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CROTQ9UKG9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CROTQ9UKG9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CROTQ9UKG9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CROTQ9UKG9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CROTQ9UKG9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CROTQ9UKG9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CROTQ9UKG9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CROTQ9UKG9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CROTQ9UKG9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CROTQ9UKG9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CROTQ9UKG9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CROTQ9UKG9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CROTQ9UKG9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CROTQ9UKG9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CROTQ9UKG9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CROTQ9UKG9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CROTQ9UKG9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CROTQ9UKG9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CROTQ9UKG9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CROTQ9UKG9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CROTQ9UKG9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CROTQ9UKG9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CROTQ9UKG9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CROTQ9UKG9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CROTQ9UKG9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CROTQ9UKG9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms