Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXL4Q9UKA2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXL4Q9UKA2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXL4Q9UKA2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXL4Q9UKA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXL4Q9UKA2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXL4Q9UKA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXL4Q9UKA2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXL4Q9UKA2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXL4Q9UKA2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXL4Q9UKA2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXL4Q9UKA2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXL4Q9UKA2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXL4Q9UKA2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL4Q9UKA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL4Q9UKA2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL4Q9UKA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXL4Q9UKA2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXL4Q9UKA2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXL4Q9UKA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXL4Q9UKA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXL4Q9UKA2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms