Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C3orf18Q9UK00 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C3orf18Q9UK00 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C3orf18Q9UK00 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C3orf18Q9UK00 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C3orf18Q9UK00 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C3orf18Q9UK00 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C3orf18Q9UK00 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C3orf18Q9UK00 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C3orf18Q9UK00 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C3orf18Q9UK00 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C3orf18Q9UK00 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C3orf18Q9UK00 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C3orf18Q9UK00 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C3orf18Q9UK00 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C3orf18Q9UK00 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C3orf18Q9UK00 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C3orf18Q9UK00 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C3orf18Q9UK00 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C3orf18Q9UK00 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C3orf18Q9UK00 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C3orf18Q9UK00 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C3orf18Q9UK00 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C3orf18Q9UK00 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C3orf18Q9UK00 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C3orf18Q9UK00 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C3orf18Q9UK00 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C3orf18Q9UK00 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C3orf18Q9UK00 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C3orf18Q9UK00 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C3orf18Q9UK00 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C3orf18Q9UK00 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms