Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MCM8Q9UJA3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM8Q9UJA3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM8Q9UJA3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCM8Q9UJA3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM8Q9UJA3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM8Q9UJA3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCM8Q9UJA3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCM8Q9UJA3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM8Q9UJA3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM8Q9UJA3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM8Q9UJA3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM8Q9UJA3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCM8Q9UJA3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCM8Q9UJA3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM8Q9UJA3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM8Q9UJA3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM8Q9UJA3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM8Q9UJA3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM8Q9UJA3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM8Q9UJA3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM8Q9UJA3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM8Q9UJA3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM8Q9UJA3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM8Q9UJA3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM8Q9UJA3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCM8Q9UJA3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCM8Q9UJA3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MCM8Q9UJA3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCM8Q9UJA3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCM8Q9UJA3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCM8Q9UJA3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms