Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEPT3Q9UH03 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEPT3Q9UH03 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEPT3Q9UH03 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEPT3Q9UH03 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SEPT3Q9UH03 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEPT3Q9UH03 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEPT3Q9UH03 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEPT3Q9UH03 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEPT3Q9UH03 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEPT3Q9UH03 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEPT3Q9UH03 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEPT3Q9UH03 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEPT3Q9UH03 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SEPT3Q9UH03 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SEPT3Q9UH03 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT3Q9UH03 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEPT3Q9UH03 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT3Q9UH03 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT3Q9UH03 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT3Q9UH03 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT3Q9UH03 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT3Q9UH03 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT3Q9UH03 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT3Q9UH03 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT3Q9UH03 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT3Q9UH03 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEPT3Q9UH03 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEPT3Q9UH03 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT3Q9UH03 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEPT3Q9UH03 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEPT3Q9UH03 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEPT3Q9UH03 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEPT3Q9UH03 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEPT3Q9UH03 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEPT3Q9UH03 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEPT3Q9UH03 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEPT3Q9UH03 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEPT3Q9UH03 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEPT3Q9UH03 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SEPT3Q9UH03 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEPT3Q9UH03 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEPT3Q9UH03 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEPT3Q9UH03 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEPT3Q9UH03 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEPT3Q9UH03 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEPT3Q9UH03 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEPT3Q9UH03 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEPT3Q9UH03 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEPT3Q9UH03 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEPT3Q9UH03 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEPT3Q9UH03 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEPT3Q9UH03 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEPT3Q9UH03 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEPT3Q9UH03 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEPT3Q9UH03 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEPT3Q9UH03 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SEPT3Q9UH03 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEPT3Q9UH03 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEPT3Q9UH03 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEPT3Q9UH03 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEPT3Q9UH03 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEPT3Q9UH03 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SEPT3Q9UH03 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEPT3Q9UH03 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEPT3Q9UH03 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEPT3Q9UH03 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEPT3Q9UH03 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEPT3Q9UH03 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEPT3Q9UH03 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEPT3Q9UH03 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SEPT3Q9UH03 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEPT3Q9UH03 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SEPT3Q9UH03 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEPT3Q9UH03 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEPT3Q9UH03 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEPT3Q9UH03 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEPT3Q9UH03 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEPT3Q9UH03 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEPT3Q9UH03 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEPT3Q9UH03 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms