Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPB1Q9UBR1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPB1Q9UBR1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPB1Q9UBR1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPB1Q9UBR1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPB1Q9UBR1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPB1Q9UBR1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UPB1Q9UBR1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPB1Q9UBR1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPB1Q9UBR1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPB1Q9UBR1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UPB1Q9UBR1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UPB1Q9UBR1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPB1Q9UBR1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPB1Q9UBR1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPB1Q9UBR1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UPB1Q9UBR1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPB1Q9UBR1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPB1Q9UBR1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPB1Q9UBR1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPB1Q9UBR1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPB1Q9UBR1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPB1Q9UBR1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPB1Q9UBR1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPB1Q9UBR1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPB1Q9UBR1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPB1Q9UBR1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UPB1Q9UBR1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPB1Q9UBR1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UPB1Q9UBR1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 707.2 ms