Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb3Q9R1P1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb3Q9R1P1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb3Q9R1P1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb3Q9R1P1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb3Q9R1P1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb3Q9R1P1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb3Q9R1P1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb3Q9R1P1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb3Q9R1P1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb3Q9R1P1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb3Q9R1P1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb3Q9R1P1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb3Q9R1P1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Psmb3Q9R1P1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Psmb3Q9R1P1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psmb3Q9R1P1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psmb3Q9R1P1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psmb3Q9R1P1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psmb3Q9R1P1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb3Q9R1P1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb3Q9R1P1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb3Q9R1P1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psmb3Q9R1P1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms