Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psma4Q9R1P0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psma4Q9R1P0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psma4Q9R1P0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psma4Q9R1P0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psma4Q9R1P0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psma4Q9R1P0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psma4Q9R1P0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psma4Q9R1P0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psma4Q9R1P0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psma4Q9R1P0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Psma4Q9R1P0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psma4Q9R1P0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psma4Q9R1P0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psma4Q9R1P0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psma4Q9R1P0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psma4Q9R1P0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma4Q9R1P0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma4Q9R1P0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma4Q9R1P0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma4Q9R1P0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psma4Q9R1P0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psma4Q9R1P0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Psma4Q9R1P0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psma4Q9R1P0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psma4Q9R1P0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma4Q9R1P0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psma4Q9R1P0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psma4Q9R1P0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma4Q9R1P0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma4Q9R1P0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma4Q9R1P0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma4Q9R1P0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma4Q9R1P0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma4Q9R1P0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma4Q9R1P0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psma4Q9R1P0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psma4Q9R1P0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psma4Q9R1P0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Psma4Q9R1P0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psma4Q9R1P0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psma4Q9R1P0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psma4Q9R1P0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psma4Q9R1P0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psma4Q9R1P0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Psma4Q9R1P0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psma4Q9R1P0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psma4Q9R1P0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Psma4Q9R1P0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psma4Q9R1P0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psma4Q9R1P0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psma4Q9R1P0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psma4Q9R1P0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psma4Q9R1P0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psma4Q9R1P0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psma4Q9R1P0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psma4Q9R1P0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psma4Q9R1P0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psma4Q9R1P0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Psma4Q9R1P0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psma4Q9R1P0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psma4Q9R1P0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psma4Q9R1P0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psma4Q9R1P0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psma4Q9R1P0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psma4Q9R1P0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psma4Q9R1P0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms