Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcm1Q9R0L6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcm1Q9R0L6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcm1Q9R0L6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcm1Q9R0L6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcm1Q9R0L6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcm1Q9R0L6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcm1Q9R0L6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcm1Q9R0L6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcm1Q9R0L6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcm1Q9R0L6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcm1Q9R0L6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcm1Q9R0L6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcm1Q9R0L6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcm1Q9R0L6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcm1Q9R0L6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcm1Q9R0L6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcm1Q9R0L6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcm1Q9R0L6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcm1Q9R0L6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcm1Q9R0L6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcm1Q9R0L6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcm1Q9R0L6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcm1Q9R0L6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcm1Q9R0L6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcm1Q9R0L6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcm1Q9R0L6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcm1Q9R0L6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcm1Q9R0L6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcm1Q9R0L6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcm1Q9R0L6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcm1Q9R0L6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcm1Q9R0L6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcm1Q9R0L6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcm1Q9R0L6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcm1Q9R0L6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcm1Q9R0L6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcm1Q9R0L6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcm1Q9R0L6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcm1Q9R0L6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcm1Q9R0L6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcm1Q9R0L6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcm1Q9R0L6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcm1Q9R0L6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcm1Q9R0L6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcm1Q9R0L6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcm1Q9R0L6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcm1Q9R0L6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcm1Q9R0L6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcm1Q9R0L6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcm1Q9R0L6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcm1Q9R0L6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Pcm1Q9R0L6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Pcm1Q9R0L6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcm1Q9R0L6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcm1Q9R0L6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcm1Q9R0L6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcm1Q9R0L6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcm1Q9R0L6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcm1Q9R0L6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcm1Q9R0L6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcm1Q9R0L6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcm1Q9R0L6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcm1Q9R0L6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcm1Q9R0L6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcm1Q9R0L6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcm1Q9R0L6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcm1Q9R0L6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcm1Q9R0L6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcm1Q9R0L6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms