Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM0

Ubqln2, Ubiquilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln2Q9QZM0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubqln2Q9QZM0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubqln2Q9QZM0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubqln2Q9QZM0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubqln2Q9QZM0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubqln2Q9QZM0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubqln2Q9QZM0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubqln2Q9QZM0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubqln2Q9QZM0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubqln2Q9QZM0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubqln2Q9QZM0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubqln2Q9QZM0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubqln2Q9QZM0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubqln2Q9QZM0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubqln2Q9QZM0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubqln2Q9QZM0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubqln2Q9QZM0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubqln2Q9QZM0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubqln2Q9QZM0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubqln2Q9QZM0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubqln2Q9QZM0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubqln2Q9QZM0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubqln2Q9QZM0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubqln2Q9QZM0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubqln2Q9QZM0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubqln2Q9QZM0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubqln2Q9QZM0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubqln2Q9QZM0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubqln2Q9QZM0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubqln2Q9QZM0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms