Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tomm40Q9QYA2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tomm40Q9QYA2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tomm40Q9QYA2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tomm40Q9QYA2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tomm40Q9QYA2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tomm40Q9QYA2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms