Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pkp3Q9QY23 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkp3Q9QY23 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkp3Q9QY23 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkp3Q9QY23 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkp3Q9QY23 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkp3Q9QY23 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkp3Q9QY23 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkp3Q9QY23 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkp3Q9QY23 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkp3Q9QY23 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkp3Q9QY23 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkp3Q9QY23 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkp3Q9QY23 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkp3Q9QY23 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkp3Q9QY23 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkp3Q9QY23 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkp3Q9QY23 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkp3Q9QY23 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkp3Q9QY23 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkp3Q9QY23 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkp3Q9QY23 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkp3Q9QY23 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkp3Q9QY23 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkp3Q9QY23 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkp3Q9QY23 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkp3Q9QY23 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkp3Q9QY23 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkp3Q9QY23 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkp3Q9QY23 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkp3Q9QY23 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkp3Q9QY23 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkp3Q9QY23 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkp3Q9QY23 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkp3Q9QY23 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkp3Q9QY23 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp3Q9QY23 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkp3Q9QY23 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkp3Q9QY23 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkp3Q9QY23 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkp3Q9QY23 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkp3Q9QY23 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp3Q9QY23 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp3Q9QY23 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkp3Q9QY23 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp3Q9QY23 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkp3Q9QY23 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkp3Q9QY23 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkp3Q9QY23 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkp3Q9QY23 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkp3Q9QY23 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkp3Q9QY23 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp3Q9QY23 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp3Q9QY23 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkp3Q9QY23 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkp3Q9QY23 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkp3Q9QY23 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkp3Q9QY23 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkp3Q9QY23 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkp3Q9QY23 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkp3Q9QY23 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkp3Q9QY23 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkp3Q9QY23 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkp3Q9QY23 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp3Q9QY23 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkp3Q9QY23 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkp3Q9QY23 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkp3Q9QY23 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkp3Q9QY23 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms