Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnip3Q9QXT8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnip3Q9QXT8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnip3Q9QXT8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnip3Q9QXT8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnip3Q9QXT8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnip3Q9QXT8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcnip3Q9QXT8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnip3Q9QXT8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnip3Q9QXT8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnip3Q9QXT8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnip3Q9QXT8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kcnip3Q9QXT8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnip3Q9QXT8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip3Q9QXT8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip3Q9QXT8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip3Q9QXT8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip3Q9QXT8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnip3Q9QXT8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnip3Q9QXT8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kcnip3Q9QXT8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kcnip3Q9QXT8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnip3Q9QXT8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnip3Q9QXT8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnip3Q9QXT8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnip3Q9QXT8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnip3Q9QXT8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kcnip3Q9QXT8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kcnip3Q9QXT8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms