Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ptf1aQ9QX98 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ptf1aQ9QX98 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ptf1aQ9QX98 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ptf1aQ9QX98 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ptf1aQ9QX98 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ptf1aQ9QX98 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ptf1aQ9QX98 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Ptf1aQ9QX98 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ptf1aQ9QX98 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ptf1aQ9QX98 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ptf1aQ9QX98 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ptf1aQ9QX98 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ptf1aQ9QX98 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ptf1aQ9QX98 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ptf1aQ9QX98 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ptf1aQ9QX98 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ptf1aQ9QX98 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Ptf1aQ9QX98 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ptf1aQ9QX98 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ptf1aQ9QX98 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ptf1aQ9QX98 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ptf1aQ9QX98 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ptf1aQ9QX98 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ptf1aQ9QX98 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ptf1aQ9QX98 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ptf1aQ9QX98 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ptf1aQ9QX98 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ptf1aQ9QX98 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ptf1aQ9QX98 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ptf1aQ9QX98 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ptf1aQ9QX98 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ptf1aQ9QX98 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ptf1aQ9QX98 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ptf1aQ9QX98 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ptf1aQ9QX98 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Ptf1aQ9QX98 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ptf1aQ9QX98 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ptf1aQ9QX98 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ptf1aQ9QX98 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ptf1aQ9QX98 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ptf1aQ9QX98 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ptf1aQ9QX98 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ptf1aQ9QX98 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ptf1aQ9QX98 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ptf1aQ9QX98 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ptf1aQ9QX98 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ptf1aQ9QX98 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ptf1aQ9QX98 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ptf1aQ9QX98 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ptf1aQ9QX98 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ptf1aQ9QX98 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ptf1aQ9QX98 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Ptf1aQ9QX98 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ptf1aQ9QX98 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ptf1aQ9QX98 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ptf1aQ9QX98 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ptf1aQ9QX98 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ptf1aQ9QX98 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ptf1aQ9QX98 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ptf1aQ9QX98 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Ptf1aQ9QX98 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ptf1aQ9QX98 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ptf1aQ9QX98 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ptf1aQ9QX98 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ptf1aQ9QX98 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ptf1aQ9QX98 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ptf1aQ9QX98 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ptf1aQ9QX98 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ptf1aQ9QX98 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ptf1aQ9QX98 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ptf1aQ9QX98 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ptf1aQ9QX98 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ptf1aQ9QX98 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ptf1aQ9QX98 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ptf1aQ9QX98 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ptf1aQ9QX98 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ptf1aQ9QX98 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ptf1aQ9QX98 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ptf1aQ9QX98 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ptf1aQ9QX98 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ptf1aQ9QX98 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ptf1aQ9QX98 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ptf1aQ9QX98 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ptf1aQ9QX98 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ptf1aQ9QX98 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ptf1aQ9QX98 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ptf1aQ9QX98 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ptf1aQ9QX98 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ptf1aQ9QX98 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ptf1aQ9QX98 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Ptf1aQ9QX98 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ptf1aQ9QX98 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ptf1aQ9QX98 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ptf1aQ9QX98 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ptf1aQ9QX98 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ptf1aQ9QX98 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ptf1aQ9QX98 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ptf1aQ9QX98 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ptf1aQ9QX98 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms