Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dkk3Q9QUN9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dkk3Q9QUN9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dkk3Q9QUN9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dkk3Q9QUN9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dkk3Q9QUN9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dkk3Q9QUN9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dkk3Q9QUN9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dkk3Q9QUN9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dkk3Q9QUN9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dkk3Q9QUN9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dkk3Q9QUN9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dkk3Q9QUN9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dkk3Q9QUN9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dkk3Q9QUN9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dkk3Q9QUN9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dkk3Q9QUN9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dkk3Q9QUN9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dkk3Q9QUN9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dkk3Q9QUN9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dkk3Q9QUN9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dkk3Q9QUN9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dkk3Q9QUN9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkk3Q9QUN9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkk3Q9QUN9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkk3Q9QUN9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dkk3Q9QUN9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dkk3Q9QUN9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dkk3Q9QUN9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dkk3Q9QUN9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dkk3Q9QUN9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dkk3Q9QUN9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dkk3Q9QUN9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dkk3Q9QUN9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dkk3Q9QUN9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Dkk3Q9QUN9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkk3Q9QUN9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkk3Q9QUN9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkk3Q9QUN9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkk3Q9QUN9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dkk3Q9QUN9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dkk3Q9QUN9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dkk3Q9QUN9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dkk3Q9QUN9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dkk3Q9QUN9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dkk3Q9QUN9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkk3Q9QUN9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dkk3Q9QUN9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dkk3Q9QUN9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dkk3Q9QUN9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dkk3Q9QUN9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dkk3Q9QUN9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Dkk3Q9QUN9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dkk3Q9QUN9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dkk3Q9QUN9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dkk3Q9QUN9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dkk3Q9QUN9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dkk3Q9QUN9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Dkk3Q9QUN9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dkk3Q9QUN9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dkk3Q9QUN9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dkk3Q9QUN9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms