Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABI3Q9P2A4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABI3Q9P2A4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABI3Q9P2A4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABI3Q9P2A4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABI3Q9P2A4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABI3Q9P2A4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABI3Q9P2A4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABI3Q9P2A4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABI3Q9P2A4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABI3Q9P2A4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABI3Q9P2A4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABI3Q9P2A4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABI3Q9P2A4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABI3Q9P2A4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABI3Q9P2A4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABI3Q9P2A4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABI3Q9P2A4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABI3Q9P2A4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABI3Q9P2A4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABI3Q9P2A4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABI3Q9P2A4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABI3Q9P2A4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABI3Q9P2A4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABI3Q9P2A4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms